在对进行处理生物质燃料时如切削木材，其工作场所很可能存在环境的问题，特别是与粉尘和微生物如真菌和细菌有关。 切削木材的主要问题是由隐藏在木材中细菌和真菌繁殖所引起的。生产木屑颗粒燃料**危险的因素则是粉尘。
 1 在健康问题上生物质燃料处理过程中，细小颗粒会随空气通过人们呼吸经咽喉进入肺，从而危害人们的健康。粉尘、细菌和真菌孢子通常只有1-5cm大小，它们也很容易被风吹起并在空气中悬浮很长时间。除了直接侧记黏膜和肺组织以外，细菌和真菌孢子还会导致过敏性反应。典型的症状有呼吸困难、感冒、发烧、颤抖、咳嗽、头疼、肌肉疼痛、关节疼、胃疼、体重减轻和一般性不适与疲劳。吸入细菌和真菌孢子所引起的疾病分为急性和慢性两种病症。
 2 急性病症通常也被称为有机粉尘中毒综合征，典型发病在暴露于菌孢子和粉尘密集的空气环境中的人群，每升空气含有高达9-10个颗粒。通常情况下每升空气只含有10-30000个菌孢。ODTS具有与流感类似的症状，如发烧、颤抖、肌肉疼痛、关节疼，可能还伴有咳嗽和轻微的呼吸困难。通常在含尘空气中暴露4-8h后出现症状，很少会超过3d。急性疾病无需治疗也不会造成**性的损伤。但需避免反复地暴露在含尘空气中，因为上述症状的患者会感到非常不舒服，而且有发展成慢性病的可能。
   3 对于慢性病症主要指的就是慢性支气管炎通常也是根据它的**初病源来命名，如打谷肺。这种慢性病的国际名称是过敏性肺泡炎，即肺组织的过敏性反应。这种疾病一般情况下不会发生，除非长时间暴露于每升空气平均含有至少2-3个细菌和真菌孢子等微生物的环境中。
   具有一些危险的工作过程就是如果有些木材切削后应尽快利用，这将很少出现微生物问题上，包括针对木屑颗粒生产线的各个工段在森林或供热厂，木屑颗粒储藏经常是无遮盖物的料堆形式，有时也用塑料薄膜或防水油布覆盖。正是这种储藏方式导致了细菌和真菌孢子的问题。
木屑颗粒机生产的燃料是由处压缩状态的刨花和锯末组成。人们确信粉尘问题与颗粒燃料的加工过程也有着相互的联系。但这个问题尚未进行深入的调查。但无论如何，一系列与粉尘和微生物有关的工作环境问题都与木屑颗粒机和木屑颗粒燃料的生产有关。
在一般情况下人们通常使用拖拉机或者牵引装载搬运储藏在森林和供热厂的木屑。当木屑被抬起时，细菌和菌孢会漂浮在空气中。如果驾驶舱没有封闭，司机将暴露于存在微生物的空气中。同样的问题也在卸货时出现。

在当木屑运抵供热厂时，需要进行取样检验含水量，取样的过程是从装载或卸载的料堆中铲子铲一些样品。取样人也暴露于存在微生物的空气中。